Search
Close this search box.

破解癌症的演算法!史丹佛研究機構 SRI International「算」出致死的癌症基因對症下藥

【我們為什麼挑選這篇文章】SRI International(史丹佛國際研究院),藏身於矽谷的非營利研究組織,過去開發過許多科技前沿的產品,包含汰漬洗衣液基礎原料、支票磁性安全墨水、滑鼠原型機、噴墨打印機 ……。現在又有一全新力作,該機構的生物小組發明了一種定位癌症中「致死基因」的技術,將用來開發更有針對性、無副作用的藥物。(責任編輯:陳君毅)

當我們談起矽谷,我們在談什麼?惠普、蘋果、Google、Facebook、特斯拉、SpaceX 的黑科技,還有每隔幾年就會突然出現在公眾視野裡的小型初創公司。

其實,還有另一群神秘的天才,在矽谷少為人知的非營利研究機構裡,用一項又一項研究成果低調地改變著我們的世界 ……。

矽谷的黃埔軍校:史丹佛國際研究院

SRI International(史丹佛國際研究院)就是這樣一家機構。過往在這裡誕生並被大公司收購或拆分出去成立公司的明星項目數不勝數:汰漬洗衣液基礎原料、支票磁性安全墨水、鼠標原型機、噴墨打印機、光盤以及 LCD 顯示器的發明,以及世界首次網際網絡通信的實現 ……。

就連蘋果操作系統裡的智能助手 Siri,一開始也是 SRI International 的內部創業項目

稱這家機構為矽谷的黃埔軍校絲毫不過分 ……。

用演算法「算」出癌症致死基因

SRI International 的研究方向還包括醫學,他們正在研究如何及早診斷和攻剋癌症!

之前醫學界早有研究發現,一些癌症由成對的基因 A 和 B 控制,它們被稱為「合成致死基因」 (Synthetic Lethals)。假設 A 基因病變失靈,B 則會擴大表達量以彌補 A 的損失,維持癌細胞繼續增生,反之亦然。如果能夠使 A 和 B 同時病變,它們控制的癌細胞就會死亡,癌症會停止擴散。

於是,醫學界開始著手利用這個理論發展醫藥和救治方案,結果卻並不理想——門檻在於,想要精確地確認這種成對基因關係,就像大海撈針一樣。

而 SRI International 的生物信息學小組,在醫學和計算機專家,史丹佛大學研究員蘇巴娜·辛(Subarna Sinha)的帶領下,取得了重大突破!

該小組開發出了一種全新的計算機算法,命名為「導彈」(Mining Synthetic Lethals, MiSL)。

通過新算法,小組對 12 種不同類型的癌症、超過 3100 個癌症相關基因病變、數以億計的基因進行篩選,精確地篩選出了 89 對合成致死基因。更令人欣慰的是,這其中有 17 對在此之前已經被發現,投入臨床應用或藥物開發——證明了 MiSL 算法的有效性!

在 PingWest 品玩上週舉辦的矽谷科技峰會 SYNC 2017 上,辛向在座數百名專業人士具體闡釋了這一新發現。據她介紹,MiSL 不僅可以用來發現潛在的合成致死基因,還可以導入新的數據源進行反向驗證,找到那些導致對已有癌症藥物產生抗藥性的基因,從而擴展出新的研究 ……。

辛指出,MiSL 算法的誕生,在對抗癌症的戰爭中具有里程碑的意義。通過 MiSL,未來我們可能會迎來對個體病人更具針對性的抗癌療法,甚至在某天完全擊敗癌症 ……。

——

(本文經合作夥伴 pingwest 授權轉載,並同意 TechOrange 編寫導讀與修訂標題,原文標題為〈矽谷“黃埔軍校”SRI International 揭曉抗癌新方法:用算法找出病變基因〉。圖片來源:Wiki, CC Licensed。)

延伸閱讀

【癌症檢驗用吹的】以色列新神技:輕吹一口氣就能測出 17 種重大疾病
台灣癌症實況主:感謝 Pokemon Go 讓我更願意出門運動、陪伴家人、突破身體的極限
山寨差點出人命!中國山寨半導體滲透歐洲百萬台重要醫療儀器與軍用設施